โครงสร้างกลุ่มงานภายใต้สถาบันการแพทย์แผนไทย
| กลุ่มงานอำนวยการ | กลุ่มงานส่งเสริมบริการการแพทย์แผนไทย | กลุ่มงานพัฒนามาตรฐานบริการการแพทย์ฯ |
| กลุ่มงานวิชาการเภสัชกรรมไทย | กลุ่มงานวิชาการเวชกรรมไทย | กลุ่มงานวิชาการการนวดไทย |
| กลุ่มงานวิชาการสมุนไพรไทย | กลุ่มงานส่งเสริมการใช้ผลิตภัณฑ์สมุนไพร | กลุ่มงานวิชาการการผดุงครรภ์ไทย |
| กลุ่มงานพัฒนามาตรฐานยาแผนไทย | กลุ่มงานพัฒนามตรฐานกำลังคนฯ | |
คำสั่งกรมการแพทย์แผนไทยและการแพทย์ทางเลือก
2. คำสั่งแต่งตั้งรองผู้อำนวยการและผู้ช่วยผู้อำนวยการสถาบันการแพทย์แผนไทย
3. คำสั่งแต่งตั้งคณะกรรมการบริหารสถาบันการแพทย์แผนไทย
4. คำสั่งมอบหมายเจ้าหน้าที่ปฏิบัติงานประจำหน่วยงานภายใต้สถาบันการแพทย์แผนไทย