โครงสร้างกลุ่มงานภายใต้สถาบันการแพทย์แผนไทย
1. กลุ่มงานอำนวยการ
2. กลุ่มงานส่งเสริมบริการการแพทย์แผนไทย
3. กลุ่มงานพัฒนามาตรฐานด้านบริการการแพทย์แผนไทย
4. กลุ่มงานวิชาการเภสัชกรรมไทย
5. กลุ่มงานวิชาการเวชกรรมไทย
6. กลุ่มงานวิชาการการนวดไทย
7. กลุ่มงานวิชาการสมุนไพรไทย
8. กลุ่มงานส่งเสริมการใช้ผลิตภัณ์สมุนไพร
9. กลุ่มงานวิชาการการผดุงภรรค์ไทย
10. กลุ่มงานพัฒนามาตรฐานยาไทย
11. กลุ่มงานพัฒนามาตรฐานกำลังคนด้านการแพทย์แผนไทย
คำสั่งแต่งตั้งผู้บริหาร หัวหน้าหน่วยงาน เจ้าหน้าที่ประจำหน่วยงานและเจ้าหน้าที่ ที่ได้รับมอบหมาย ของสถาบันการแพทย์แผนไทย