โครงสร้างกลุ่มงานภายใต้สถาบันการแพทย์แผนไทย

1. กลุ่มงานอำนวยการ 

2. กลุ่มงานส่งเสริมบริการการแพทย์แผนไทย

3. กลุ่มงานพัฒนามาตรฐานด้านบริการการแพทย์แผนไทย

4. กลุ่มงานวิชาการเภสัชกรรมไทย

5. กลุ่มงานวิชาการเวชกรรมไทย

6. กลุ่มงานวิชาการการนวดไทย

7. กลุ่มงานวิชาการสมุนไพรไทย

8. กลุ่มงานส่งเสริมการใช้ผลิตภัณ์สมุนไพร

9. กลุ่มงานวิชาการการผดุงภรรค์ไทย

10. กลุ่มงานพัฒนามาตรฐานยาไทย

11. กลุ่มงานพัฒนามาตรฐานกำลังคนด้านการแพทย์แผนไทย

คำสั่งแต่งตั้งผู้บริหาร หัวหน้าหน่วยงาน เจ้าหน้าที่ประจำหน่วยงานและเจ้าหน้าที่ ที่ได้รับมอบหมาย ของสถาบันการแพทย์แผนไทย